一般认为,黄帝时代是从母系氏族向父系氏族社会过渡的时代。首先,从婚姻关系来看,黄帝娶有四个妻室。《史记·五帝本纪》云:“黄帝居轩辕之丘,而娶于西陵之女,是为嫘祖。嫘祖为黄帝正妃。”除“正妃”嫘祖外,黄帝还有三个“次妃”。一个是方雷氏之女,一个是彤鱼氏之女,一个是嫫母。这说明当时已经开始形成女嫁男且以男性为主的家庭模式,男性在婚姻关系上开始居于主导地位。在西安半坡遗址中,发现有些房子内,有自己的生产工具,自己的粮瓮,自己的灶塘,显然是小家庭的情况。在浙江下川王岗仰韶文化遗址中,出现成排的小房间,也是小家庭的证明。大汶口文化遗址中发现男女合葬墓,普遍是男左女右,这是一夫一妻制的实例。
其次,从图腾的象征意义来看,图腾的象征意义已向始祖转化。母系氏族社会,人们“不知其父”,将本氏族的来源归结为始妣与图腾结合的产物。因此在母系社会里,只有始妣概念没有始祖观念。随着进入父系制,始祖的意义开始凸现,图腾与始祖发生联系。有多少图腾,就有多少个始祖,每一个信奉同样图腾的部落,必然会认为本部落的生命来源于同一个祖先。
这个变化,在有关黄帝的史料中都有所表现。黄帝的子孙,传说有二十五人之多,而二十五个子孙,也并非某始妣感图腾而生,而是黄帝与嫘祖、方雷氏、彤鱼氏、嫫母结合的结果。黄帝就是他们的始祖。